วัดโยธานิมิต เป็นวัดเก่าแก่ประจำเมืองจันทบุรี สร้างในรัชสมัยพระบาทสมเด็จพระนั่งเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 3 จากศิลาจารึกวัดโยธานิมิต กล่าวถึงประวัติการสร้างวัดว่า สร้าง พ.ศ. 2377 เจ้าพระยาคลังว่าที่พระสมุหกลาโหม ให้สร้างป้อมขึ้นที่ปากน้ำแหลมสิงห์ฝั่งตะวันออก 1 ป้อม ส่วนป้อมเก่าให้ซ่อมแซม รวมถึงสร้างป้อมปราการบริเวณเนินวง ( ค่ายเนินวง เมืองจันทบุรีเก่า ) แล้วเสร็จใน พ.ศ. 2388 จากนั้นจึงชักชวนนายทัพนายกองและเจ้าเมืองต่างๆ ร่วมกันสร้างวัดใช้เวลา 4 เดือน ถวายนามว่าวัดโยธานิมิต มีการระบุรายนามผู้สร้าง และรายการก่อสร้าง ตอนท้ายอธิษฐานให้ได้พบพระพุทธเจ้าทุกพระองค์ และถึงแก่นิพพานในที่สุด
หลวงพ่อใหญ่ หรือ พระมงคลเทพนิมิต พระประธานประดิษฐานภายในอุโบสถเป็นพระพุทธรูปปางสมาธิ ขนาดหน้าตักกว้าง 4 เมตร หล่อด้วยดินศิลาแลง ผสมงบน้ำอ้อย สร้างขึ้นคราวเดียวกันกับการก่อสร้างอุโบสถหลังเก่า เป็นที่เคารพนับถือของเมืองจันท์ โดยมีความเชื่อว่าท่านมีเมตตามหานิยม และแคล้วคลาด